发育肺细胞图谱提供了有关肺部疾病起源的见解
一个国际研究小组报告说,正在发育的人类肺部已被绘制得非常详细,同时在此过程中发现了发育细胞与肺癌之间的新联系。这项最新研究“人类胎儿肺细胞图谱揭示了分化的近端-远端梯度和上皮命运的关键调节因子”,出现在Cell中,并且是绘制人体每种细胞类型的人类细胞图谱计划的一部分。
WellcomeSanger研究所、EMBL的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)、剑桥大学Gurdon研究所的科学家和合作者检查了哪些基因在肺发育的不同阶段被激活,一次一个细胞。他们将其与精确定位细胞确切位置的空间技术相结合,创建了发育肺细胞图谱,展示了呼吸系统是如何形成的。
“我们展示了人类肺部发育的多组学细胞图谱,它结合了单细胞RNA和ATAC测序、高通量空间转录组学和单细胞成像。将单细胞方法与空间分析相结合,可以在受孕后5-22周内对上皮细胞、间充质细胞、内皮细胞和红细胞/白细胞区室进行全面的细胞调查,”研究人员写道。
“我们在所有隔室中识别出以前未表征的细胞状态。这些包括发育特异性分泌祖细胞和与人类小细胞肺癌相关的神经内分泌细胞亚型。我们的数据集可通过我们的网络界面获得。为了说明它的普遍用途,我们使用我们的细胞图谱来生成关于细胞间信号传导和转录因子层次结构的预测,我们使用类器官模型对其进行了严格测试。”
免费资源
据研究人员称,该图集提供了一种独特且可免费获得的资源,不仅描述了肺部形成时产生的单个细胞,还描述了这些过程是如何受基因控制的,他们补充说,它还可以作为指南健康的肺部发育,可以用作研究肺部疾病起源的基线。它还可用于创建新模型来研究肺部状况和测试潜在疗法。
为了创建这个发育肺细胞图谱,WellcomeSangerInstitute的研究人员和合作者将早期细胞的单细胞测序与空间技术相结合,生成了一个深入的肺发育数据集。Atlas描述了发育中的肺结构中存在哪些细胞类型以及这些细胞类型是如何被调节的。
该团队确定了144种细胞类型,例如中间细胞类型和过渡细胞类型,包括可能与生命后期人类小细胞肺癌的发展相关的亚型,使用图谱预测肺细胞的发育方式,尤其是哪些基因是推动这一过程的关键因素。然后,他们使用类器官模型来验证新出现的假设,证明该图谱可用于准确预测参与组织发育的阶段和细胞。
另一项研究正在使用该数据集来调查新生儿肺部疾病,目的是揭示有关因果机制的见解并开发新的类器官模型以帮助进一步研究。
“我们的高分辨率计算分析已经确定了发育中的人类肺部中以前未被描述和罕见的群体,”WellcomeSanger研究所和EMBL-EBI的共同第一作者PengHe博士说。
“在这些新人群中,我们发现了一种与成人中一种知之甚少的小肺癌相关的疾病。虽然需要进一步研究来理解这种联系,但这显示了对发育和疾病共有机制的重要见解,这些机制可以使用我们独特的细胞图谱找到。除此之外,通过包括染色质可及性数据和体外微扰实验,我们的工作展示了关键转录因子如何单独决定谱系选择,让我们开始了解控制分化途径的调控逻辑。”
免责声明:本文由用户上传,与本网站立场无关。财经信息仅供读者参考,并不构成投资建议。投资者据此操作,风险自担。 如有侵权请联系删除!
-
【木岛法子介绍】木岛法子(Kazuko Kikuchi)是日本著名演员、模特及艺人,以其在影视作品中的出色表现和独特...浏览全文>>
-
【木代尔是什么面料】“木代尔是什么面料”是许多消费者在选购衣物时常常会提出的问题。木代尔是一种天然纤维...浏览全文>>
-
【木代尔和莫代尔哪种面料好】在选择衣物面料时,很多人会遇到“木代尔”和“莫代尔”这两个名称,容易混淆它...浏览全文>>
-
【萝卜的营养价值】萝卜是一种常见的根茎类蔬菜,不仅味道清脆爽口,还具有丰富的营养价值。无论是生吃、炒食...浏览全文>>
-
【萝卜的药用功效和作用】萝卜,作为日常生活中常见的蔬菜之一,不仅味道清脆、营养丰富,还具有多种药用价值...浏览全文>>
-
【萝卜的家常做法】萝卜是一种非常常见的蔬菜,不仅价格实惠,而且营养丰富,适合多种烹饪方式。无论是炖、炒...浏览全文>>
-
【萝卜的功效与作用与主治】萝卜是一种常见的根茎类蔬菜,广泛种植于世界各地,具有丰富的营养价值和多种药用...浏览全文>>
-
【萝卜刀怎么玩儿】“萝卜刀”作为一种近年来在网络上逐渐流行的玩具,因其独特的玩法和趣味性吸引了大量年轻...浏览全文>>
-
【萝卜刀是什么】“萝卜刀”是近年来在网络上迅速走红的一种玩具,因其外形酷似胡萝卜而得名。它不仅是一种简...浏览全文>>
-
【萝卜刀的危害】近年来,“萝卜刀”作为一种新型玩具,因其造型独特、操作简单而受到部分青少年的喜爱。然而...浏览全文>>